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本系擁有各種植物病害診斷，研究微生物，分子生物學及其理化特性等珍貴儀器設備 ，以輔助教授及學生們 順利執行各種研究計畫。 茲概略介紹部份重要儀器設備如下： 連結： 系貴重儀器設備清單【50萬以上】 |
| 儀器名稱 | 用途 |
| 穿透式電子顯微鏡 1台 | 觀察細胞及病毒之微細構造 |
| 掃瞄式電子顯微鏡 1台 | 生物樣品觀察 |
| Zeiss UMSP80型顯微分光儀 | 生物樣品成份分析 |
| 高效層析儀 | 生物樣品分析 |
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Zeiss螢光顯微鏡 3台 |
微生物及螢光抗體反應之觀察 |
| 氣體層析儀 | 生物樣品分析 |
| 低迷光分光光譜 | 核蛋白測定 |
| 低壓層析儀 | 病毒純化 |
| 超音波細胞震碎儀 | 打碎微生物細胞 |
| 超薄切片機 | 超薄切片 |
| 脈衝電泳裝置 | 生物樣品分析 |
| 細菌自動稀釋計數器 | 細菌數目之測定 |
| 桌上型超高速離心機 | 大量純化細菌質體用 |
| 超高速離心機 | 大量純化病毒及核酸 |
| 高速離心機 | 一般純化用 |
| －７０℃冷凍冰箱 | 保存材料 |
| 二氧化碳測定及標定儀 | 測定及標定二氧化碳濃度 |
| 氣象數字自動記錄器 | 氣象資料記錄分析 |